Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CTU1Q7Z7A3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CTU1Q7Z7A3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTU1Q7Z7A3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTU1Q7Z7A3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms