Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HS2ST1Q7LGA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HS2ST1Q7LGA3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HS2ST1Q7LGA3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HS2ST1Q7LGA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HS2ST1Q7LGA3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms