Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RFX8Q6ZV50 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RFX8Q6ZV50 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFX8Q6ZV50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFX8Q6ZV50 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms