Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NHLRC1Q6VVB1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NHLRC1Q6VVB1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NHLRC1Q6VVB1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms