Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD300LDQ6UXZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD300LDQ6UXZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD300LDQ6UXZ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD300LDQ6UXZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms