Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSSK4Q6SA08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSSK4Q6SA08 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSSK4Q6SA08 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSSK4Q6SA08 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms