Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM220Q6QAJ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM220Q6QAJ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM220Q6QAJ8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM220Q6QAJ8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM220Q6QAJ8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms