Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC70Q6NSX1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC70Q6NSX1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC70Q6NSX1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC70Q6NSX1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms