Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AGAP6Q5VW22 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP6Q5VW22 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP6Q5VW22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP6Q5VW22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms