Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PRAMEF20Q5VT98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEF20Q5VT98 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRAMEF20Q5VT98 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRAMEF20Q5VT98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms