Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LINC01545Q5VT33 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LINC01545Q5VT33 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01545Q5VT33 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01545Q5VT33 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms