Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N8

FAM27D1, Protein FAM27D1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27D1Q5T7N8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FAM27D1Q5T7N8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FAM27D1Q5T7N8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM27D1Q5T7N8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM27D1Q5T7N8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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