Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OTUD3Q5T2D3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD3Q5T2D3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD3Q5T2D3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTUD3Q5T2D3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms