Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COLEC12Q5KU26 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COLEC12Q5KU26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
COLEC12Q5KU26 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COLEC12Q5KU26 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms