Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR44Q5JSH3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR44Q5JSH3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR44Q5JSH3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
WDR44Q5JSH3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms