Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C3orf38Q5JPI3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
C3orf38Q5JPI3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf38Q5JPI3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf38Q5JPI3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms