Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRRT3Q5FWE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRRT3Q5FWE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRRT3Q5FWE3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms