Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDCD4Q53EL6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDCD4Q53EL6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDCD4Q53EL6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms