Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FBXO43Q4G163 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FBXO43Q4G163 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FBXO43Q4G163 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FBXO43Q4G163 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms