Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRTAP27-1Q3LI81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRTAP27-1Q3LI81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP27-1Q3LI81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms