Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TYSND1Q2T9J0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TYSND1Q2T9J0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TYSND1Q2T9J0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TYSND1Q2T9J0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms