Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC142Q17RM4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC142Q17RM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC142Q17RM4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC142Q17RM4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC142Q17RM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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