Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FXNQ16595 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FXNQ16595 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FXNQ16595 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FXNQ16595 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FXNQ16595 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FXNQ16595 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FXNQ16595 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FXNQ16595 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FXNQ16595 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FXNQ16595 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FXNQ16595 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FXNQ16595 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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