Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZIC1Q15915 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZIC1Q15915 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZIC1Q15915 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZIC1Q15915 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms