Protein–RNA interactions for Protein: Q15800

MSMO1, Methylsterol monooxygenase 1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMO1Q15800 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MSMO1Q15800 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
MSMO1Q15800 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MSMO1Q15800 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms