Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TCEA2Q15560 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCEA2Q15560 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCEA2Q15560 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TCEA2Q15560 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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