Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPRRQ15256 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRRQ15256 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRRQ15256 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRRQ15256 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRRQ15256 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms