Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KARSQ15046 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KARSQ15046 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KARSQ15046 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KARSQ15046 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KARSQ15046 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KARSQ15046 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KARSQ15046 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KARSQ15046 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KARSQ15046 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KARSQ15046 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KARSQ15046 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KARSQ15046 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KARSQ15046 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KARSQ15046 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KARSQ15046 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KARSQ15046 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KARSQ15046 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KARSQ15046 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KARSQ15046 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KARSQ15046 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KARSQ15046 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KARSQ15046 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KARSQ15046 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KARSQ15046 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
KARSQ15046 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KARSQ15046 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KARSQ15046 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KARSQ15046 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KARSQ15046 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
KARSQ15046 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KARSQ15046 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KARSQ15046 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KARSQ15046 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KARSQ15046 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KARSQ15046 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
KARSQ15046 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KARSQ15046 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KARSQ15046 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KARSQ15046 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KARSQ15046 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
KARSQ15046 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
KARSQ15046 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KARSQ15046 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KARSQ15046 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KARSQ15046 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KARSQ15046 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KARSQ15046 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KARSQ15046 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KARSQ15046 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KARSQ15046 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KARSQ15046 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KARSQ15046 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
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