Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FRMPD4Q14CM0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FRMPD4Q14CM0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FRMPD4Q14CM0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FRMPD4Q14CM0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1408 ms