Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1CQ13936 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1CQ13936 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1CQ13936 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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