Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

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Length 783 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RIN1Q13671 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIN1Q13671 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIN1Q13671 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms