Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIGQ13278 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms