Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RIGQ13278 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RIGQ13278 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIGQ13278 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIGQ13278 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RIGQ13278 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RIGQ13278 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIGQ13278 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIGQ13278 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIGQ13278 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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