Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NR1H3Q13133 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NR1H3Q13133 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NR1H3Q13133 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NR1H3Q13133 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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