Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB3Q12988 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB3Q12988 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPB3Q12988 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB3Q12988 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
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