Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFX1Q12986 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFX1Q12986 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NFX1Q12986 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NFX1Q12986 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NFX1Q12986 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
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