Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NPRL3Q12980 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPRL3Q12980 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NPRL3Q12980 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NPRL3Q12980 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
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