Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TROQ12816 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
TROQ12816 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
TROQ12816 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
TROQ12816 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
TROQ12816 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TROQ12816 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TROQ12816 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
TROQ12816 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
TROQ12816 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
TROQ12816 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TROQ12816 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TROQ12816 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
TROQ12816 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
TROQ12816 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TROQ12816 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
TROQ12816 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
TROQ12816 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
TROQ12816 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
TROQ12816 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TROQ12816 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
TROQ12816 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TROQ12816 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
TROQ12816 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TROQ12816 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
TROQ12816 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TROQ12816 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
TROQ12816 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
TROQ12816 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
TROQ12816 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TROQ12816 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TROQ12816 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
TROQ12816 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TROQ12816 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TROQ12816 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TROQ12816 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
TROQ12816 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TROQ12816 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
TROQ12816 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TROQ12816 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
TROQ12816 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TROQ12816 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TROQ12816 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TROQ12816 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TROQ12816 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TROQ12816 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TROQ12816 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
TROQ12816 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TROQ12816 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
TROQ12816 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TROQ12816 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TROQ12816 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
TROQ12816 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
TROQ12816 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
TROQ12816 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TROQ12816 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TROQ12816 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TROQ12816 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TROQ12816 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
TROQ12816 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TROQ12816 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TROQ12816 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TROQ12816 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
TROQ12816 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
TROQ12816 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TROQ12816 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
TROQ12816 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TROQ12816 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TROQ12816 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TROQ12816 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TROQ12816 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TROQ12816 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TROQ12816 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TROQ12816 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TROQ12816 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TROQ12816 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TROQ12816 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
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