Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LAMTOR4Q0VGL1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LAMTOR4Q0VGL1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LAMTOR4Q0VGL1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LAMTOR4Q0VGL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms