Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUNX1T1Q06455 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUNX1T1Q06455 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUNX1T1Q06455 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUNX1T1Q06455 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms