Protein–RNA interactions for Protein: Q06413

MEF2C, Myocyte-specific enhancer factor 2C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEF2CQ06413 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEF2CQ06413 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MEF2CQ06413 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MEF2CQ06413 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MEF2CQ06413 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms