Protein–RNA interactions for Protein: Q06190

PPP2R3A, Serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B'' subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R3AQ06190 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP2R3AQ06190 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP2R3AQ06190 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPP2R3AQ06190 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPP2R3AQ06190 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms