Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC18A2Q05940 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC18A2Q05940 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC18A2Q05940 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC18A2Q05940 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC18A2Q05940 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms