Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL6Q02878 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPL6Q02878 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPL6Q02878 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPL6Q02878 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms