Protein–RNA interactions for Protein: Q01955

COL4A3, Collagen alpha-3(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3Q01955 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL4A3Q01955 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL4A3Q01955 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COL4A3Q01955 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL4A3Q01955 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms