Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SATB1Q01826 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SATB1Q01826 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SATB1Q01826 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB1Q01826 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms