Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDC42EP1Q00587 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC42EP1Q00587 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC42EP1Q00587 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC42EP1Q00587 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms