Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
EFNB1P98172 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EFNB1P98172 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EFNB1P98172 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EFNB1P98172 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms