Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
H3F3AP84243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H3F3AP84243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
H3F3AP84243 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
H3F3AP84243 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.7 ms