Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PITX1P78337 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PITX1P78337 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PITX1P78337 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITX1P78337 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PITX1P78337 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PITX1P78337 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITX1P78337 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITX1P78337 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PITX1P78337 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PITX1P78337 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITX1P78337 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITX1P78337 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PITX1P78337 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITX1P78337 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PITX1P78337 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PITX1P78337 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITX1P78337 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITX1P78337 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITX1P78337 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PITX1P78337 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PITX1P78337 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PITX1P78337 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PITX1P78337 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PITX1P78337 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PITX1P78337 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PITX1P78337 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PITX1P78337 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PITX1P78337 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITX1P78337 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PITX1P78337 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITX1P78337 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PITX1P78337 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PITX1P78337 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PITX1P78337 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITX1P78337 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITX1P78337 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITX1P78337 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PITX1P78337 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITX1P78337 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITX1P78337 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITX1P78337 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITX1P78337 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PITX1P78337 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITX1P78337 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITX1P78337 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITX1P78337 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PITX1P78337 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PITX1P78337 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITX1P78337 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITX1P78337 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PITX1P78337 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PITX1P78337 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITX1P78337 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITX1P78337 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITX1P78337 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PITX1P78337 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms