Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTA1P68133 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTA1P68133 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTA1P68133 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms